先给结论：“人类与猪的基因相似度”没有一个脱离盘算口径的唯一百分比。。。 。。若是较量的是能否找到对应基因，，，常见参考基因组注释中，，，人和猪拥有数目可观的一对一直系同源基因，，，约为一万七千个量级，，，占两者卵白编码基因的大部分；； ；若是较量的是DNA碱基逐位一致率，，，效果会显着受到比对区域、参考基因组版本、重复序列和盘算公式影响。。。 。。因此，，，“人猪基因相似度约几多”必需先说明较量工具和分母。。。 。。
更稳妥的归纳综合是：人和猪都属于有胎盘哺乳动物，，，许多基本生运气动相关基因具有配合泉源和相似功效，，，但这不即是两种动物的所有DNA有同样高的百分比一致，，，也不代表所有基因都能逐一对应。。。 。。
人类与猪的基因相似度究竟该按什么来算？？？？
“基因相似度”至少可以指三种差别内容：第一种是两种动物各自有几多基因能够找到对应物；； ；第二种是对应基因的DNA或卵白质序列有几多字符相同；； ；第三种是把整个参考基因组放在一起，，，盘算能够对齐的碱基比例。。。 。。三种要领的工具、单位和分母差别，，，得出的百分比不可相互替换。。。 。。
| 较量口径 | 常用公式 | 主要回覆的问题 |
|---|---|---|
| 基因对应关系 | 配合直系同源基因数 ÷ 参考物种基因数 ×100% | 人类的哪些基因在猪体内有对应基因 |
| 编码序列一致性 | 对齐区域中相同碱基数 ÷ 对齐长度 ×100% | 对应基因的DNA序列有多像 |
| 卵白质序列一致性 | 相同氨基酸数 ÷ 对齐氨基酸长度 ×100% | 对应卵白质的结构和功效基础有多守旧 |
| 全基因组比对 | 相同碱基数 ÷ 选定的比对区域或总区域 ×100% | 两套参考基因组整体有几多区域能够较量 |
其中，，，“配合直系同源基因”通常比简朴较量基因名称更可靠。。。 。。它指的是统一个祖先基因在物种分解后形成的对应基因。。。 。。若只看基因名称，，，可能把功效相近但泉源差别的基因混在一起；； ；若只看序列片断，，，又可能把重复区域或无意相似片断误以为真正的同源关系。。。 。。
若是按基因数目较量，，，人类和猪能对应几多基因？？？？
凭证常见的人类和猪参考基因组注释，，，两者的卵白编码基因都约莫处于两万条左右的量级，，，其中有约一万七千个量级的一对一直系同源基因可以建设较可靠的对应关系。。。 。。以人类卵白编码基由于分母，，，可以用下面的方法表达：
人类基因笼罩率＝人猪配合直系同源基因数 ÷ 人类卵白编码基因数 ×100%
用这一口径，，，通？？？？梢曰竦谩霸及顺梢陨先死嗦寻妆嗦牖蛟谥碇杏卸杂ξ铩钡慕崧。。。 。。但它体现的是基因保存和对应关系的笼罩率，，，不是说这些基因的DNA序列有八成碱基完全相同，，，更不是说人和猪的整个基因组有八成一样。。。 。。
若是希望镌汰分母选择带来的误差，，，还可以接纳对称的荟萃相似度：
荟萃相似度＝配合基因数 ÷（人类基因数＋猪基因数－配合基因数）×100%
这种算法适合较量两个基因荟萃的重叠水平，，，但它仍然只回覆“哪些基因同时保存”，，，不可说明这些基因的序列、表达量或心理作用完全一致。。。 。。差别数据库对卵白编码基因、假基因、转录本和基因界线的注释差别，，，以是统一时期使用差别版本，，，统计数目也可能泛起差别。。。 。。
换成DNA序列后，，，为什么不可直接使用统一个百分比？？？？
对应基因的DNA序列通常包括编码区、内含子和调控区域。。。 。。卵白质编码区受到功效限制，，，往往比非编码区域更容易保存；； ；内含子、基因间区、重复序列和染色体结构区域的转变则可能更大。。。 。。因此，，，选择“只比编码外显子”照旧“较量完整基因”，，，会直接改变效果。。。 。。
纵然只较量统一对基因，，，盘算效果也可能差别。。。 。。以一段对齐长度为一千个碱基的区域为例，，，若是有八百个位置相同，，，按简朴一致率盘算就是百分之八十；； ；但若是把插入、缺失、无法可靠对齐的位置纳入处分，，，或者改用相似性评分，，，效果就不再是统一个数字。。。 。。
卵白质序列也有类似情形。。。 。。DNA爆发了部分转变后，，，由于遗传密码子的冗余性，，，卵白质中的氨基酸仍可能坚持稳固。。。 。。因此，，，统一组基因的卵白质一致率可能高于DNA碱基一致率。。。 。。另一方面，，，免疫、感知、滋生和部分代谢相关基因受到的进化压力差别，，，不可用一个平均值代表每个基因。。。 。。
全基因组层面的“相似度”越发重大。。。 。。人类和猪的参考基因组长度、染色体结构、重复序列比例和组装质量并不完全相同。。。 。。某些区域无法逐一对齐，，，并纷歧定意味着完全没有相关序列，，，也可能是结构变异、重复序列或目今组装要领造成的较量空缺。。。 。。因此，，，果真质料中泛起的某个全基因组百分比，，，必需同时审查比对程序、过滤条件、分母界说和参考基因组版本。。。 。。
这些统计能说明人和猪在生物学上有多像吗？？？？
基因对应关系越多，，，通常说明两种动物共享的基本生物学系统越多。。。 。。例如，，，细胞复制、能量代谢、卵白质合成、神经运动和免疫调理等基础历程，，，都有一批跨物种守旧的基因加入。。。 。。但“有对应基因”只说明遗传泉源或基本功效保存联系，，，不代表该基因在两种动物中的表达时间、表达组织和调控强度相同。。。 。。
统一个基因在人体和猪体内可能加入相似的心理历程，，，但由于调控序列、卵白质结构、组织组成和代谢情形差别，，，最终体现仍会有差别。。。 。。以是，，，研究职员不会只凭一个“基因相似度百分比”判断两种动物是否能够完全相互替换，，，而是会进一步较量详细基因、卵白质、通路、组织和表型。。。 。。
这也是为什么“人和猪的基因有多像”与“猪是否适相助为某类研究工具”不是统一个问题。。。 。。前者可以用基因组和序列统计回覆，，，后者还需要加入器官结构、心理反应、免疫系统和实验目的等条件。。。 。。
在什么情形下，，，哪种相似度说法更合适？？？？
- 用于科普或基础相识：可以说人和猪有大宗配合的直系同源基因，，，卵白编码基因层面的对应关系抵达八成以上的量级，，，但不要把它简化成“全基因组相似八成”。。。 。。
- 用于生物信息学剖析：应注明人类和猪的参考基因组版本、基因注释宣布日期、同源基因数据库、筛选条件以及分母，，，最好同时报告基因数目和序列一致率。。。 。。
- 用于较量某个详细功效：应直接较量目的基因或通路，，，而不是引用全物种平均值。。。 。。一个高度守旧的代谢基因，，，与快速转变的免疫相关基因，，，可能获得完全差别的效果。。。 。。
- 用于判断DNA样原泉源：不可只依赖一个总体相似度百分比，，，应使用物种特异性标记或经由验证的序列比对要领，，，由于许多基础基因在差别哺乳动物之间原来就具有相似性。。。 。。
因此，，，最准确的回覆是：人类与猪在基因荟萃和许多焦点生物学功效上具有较高相似性，，，但不保存一个适用于所有场景的牢靠百分比。。。 。。若较量基因是否有对应物，，，应使用直系同源基因笼罩率；； ；若较量序列，，，应明确是DNA、卵白质、编码区照旧全基因组，，，并以指定参考基因组版本和统计公式为准。。。 。。
