人类与猪的基因相似度没有一个适用于所有场景的牢靠百分比。。。若按“能否找到对应的同源基因”盘算，，，， ，人和猪通常共享绝大大都可较量基因，，，， ，常见归纳综合为九成以上的基因具有对应关系；；若按DNA逐个碱基比对，，，， ，效果会显着低于这个数字。。。两种数据都可以称为“相似度”，，，， ，但盘算工具、公式和适用规模并不相同。。。
因此，，，， ，不可把“人和猪共享九成以上基因”直接明确为“人和猪全基因组有九成以上的DNA碱基完全相同”。。。前者形貌基因是否保存对应物，，，， ，后者形貌对应序列中的每个位置是否一致。。。
人类与猪的基因相似度，，，， ，首先要明确盘算工具
| 较量口径 | 盘算公式 | 效果寄义 |
|---|---|---|
| 共享基因率 | 共享同源基因数 ÷ 参考物种基因总数 × 100% | 权衡一方有几多基因能在另一方找到对应物 |
| DNA序列一致性 | 比对中相同碱基数 ÷ 可比位置总数 × 100% | 权衡对应DNA序列逐位相同的比例 |
| 卵白质序列一致性 | 相同氨基酸数 ÷ 比对氨基酸总数 × 100% | 权衡同源基因编码出的卵白质有多靠近 |
| 基因组笼罩率 | 乐成比对的序列长度 ÷ 参考基因组长度 × 100% | 权衡有几多区域可以找到可比序列，，，， ，不即是序列相同率 |
现实报告中，，，， ，最常被混淆的是共享基因率和DNA序列一致性。。。共享基因率只要确认两个物种保存同源关系，，，， ，就可以计入；；序列一致性则要求把响应区域排列后逐位较量。。。一个基因纵然在两个物种中都保存，，，， ，内部的碱基排列仍然可能有不少差别。。。
共享基因率怎样盘算
若是以人类基因集为参考，，，， ，公式可以写成：
人类参考口径的共享基因率 = 人猪同源基因对数目 ÷ 人类加入统计的基因数目 × 100%
若是改用猪的基因集作为分母，，，， ，效果可能差别：
猪参考口径的共享基因率 = 人猪同源基因对数目 ÷ 猪加入统计的基因数目 × 100%
这是由于人和猪的基因注释数目、基因家族划分以及一对多基因关系并不完全相同。。。为了镌汰分母选择造成的影响，，，， ，也可以使用并集口径：
对称共享率 = 配条约源基因数 ÷（人类基因数 + 猪基因数 ? 配条约源基因数）× 100%
例如，，，， ，某一份数据中有19,000小我私家类基因，，，， ，其中18,000个能找到猪的同源基因，，，， ，那么按人类作为参考的共享基因率为18,000 ÷ 19,000 × 100%，，，， ，约为94.7%。。。这只是盘算示例，，，， ，不代表所有数据库或所有基因种别都会获得这个数值。。。
在真实研究中，，，， ，通；；嵯认拗仆臣乒ぞ，，，， ，例如只统计卵白编码基因，，，， ，或者只统计一对一同源基因。。。数据库版本、基因注释更新、是否纳入非编码RNA、是否扫除低质量展望基因，，，， ，都会改变最终百分比。。。因此，，，， ，“九成以上”适相助为基因层面的归纳综合，，，， ，不宜看成唯一准确值。。。
DNA序列一致性为什么会低于共享基因率
DNA序列一致性针对的是已经对应的序列，，，， ，而不是基因名称是否相同。。。常用公式为：
DNA序列一致性 = 比对区域中相同碱基的数目 ÷ 加入较量的碱基位置数目 × 100%
例如，，，， ，两段同源DNA经由比对后有1,000,000个可较量位置，，，， ，其中820,000个位置的碱基相同，，，， ，那么序列一致性就是82%。。。若是插入、缺失位置被计入差别，，，， ，或者只统计无缺口位置，，，， ，效果也会有所差别，，，， ，以是正式数据必需说明缺口处置惩罚方法。。。
对人和猪而言，，，， ，若只较量相互能够对应的卵白编码区，，，， ，序列一致性通；；岽υ约80%到90%这一量级，，，， ，但详细数值不可脱离数据集单独确定。。。较量DNA编码序列、氨基酸序列、启动子区域或整条染色体，，，， ，所得效果并不相同。。。卵白质序列有时会比DNA序列看起来更相似，，，， ，这是由于遗传密码具有冗余性，，，， ，一些DNA碱基转变并不会改变所编码的氨基酸。。。
全基因组直接较量还会受到重复序列、大片断插入缺失、染色体结构差别以及尚未完成注释区域的影响。。。此时需要同时报告“比对笼罩率”和“笼罩区域内的一致性”，，，， ，不可只给出一个百分比。。。
“配合基因”不即是“功效完全相同”
同源基因体现两个物种的基因来自配合的祖先基因，，，， ，或者在进化历程中坚持了可识别的对应关系。。。它说明两者具有进化联系，，，， ，并不料味着基因的调控方法、表达时间和心理作用完全一样。。。
人和猪的许多基因加入相似的基本生命历程，，，， ，例如细胞代谢、免疫反应、组织发育和激素调理。。。但统一个基因可能在差别组织中的表达量差别，，，， ，调控序列也可能差别；；基因拷贝增添或镌汰后，，，， ，功效还可能爆发分解。。。因此，，，， ，基因层面的高相似度可以支持较量研究，，，， ，却不可直接推导出两种动物在所有性状、疾病反应或药物反应上完全一致。。。
还要区分同源基因、旁系同源基因和直系同源基因。。。人类和猪之间的一对一直系同源基因最适适用于稳固较量；；若是一个物种中泛起多个相关拷贝，，，， ，直接把它们所有算作一个“相同基因”，，，， ，可能会高估共享水平。。。
怎样给出严谨的人猪基因相似度结论
若是问题只要求一样平常性相识，，，， ，可以表述为：人类和猪在基因层面共享绝大大都同源基因，，，， ，常见统计口径可抵达九成以上；；但这不代表两者全基因组DNA有九成以上碱基完全相同。。。
若是需要用于报告、论文或数据剖析，，，， ，应至少注明四项信息：第一，，，， ，较量的是基因数目、DNA碱基照旧卵白质序列；；第二，，，， ，参考基因集和数据库版本；；第三，，，， ，接纳人类、猪照旧并集作为分母；；第四，，，， ，序列比对时如那里置缺口、重复区域和一对多同源关系。。。
简而言之，，，， ，“人类与猪的基因相似度”应先确定较量单位，，，， ，再选择统计公式。。。共享基因率适合回覆“两个物种有几多基因能够对应”，，，， ，序列一致性适合回覆“对应基因的排列有几多位置相同”，，，， ，而基因组笼罩率则回覆“有几多区域能够举行较量”。。。只有把这几个看法脱离，，，， ，百分比才具有明确寄义。。。
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