DNA与RNA实验判别要领的选择，，主要取决于样品是否纯净、可用量几多，，以及实验只需要快速定性，，照旧要确认样品中是否同时含有DNA和RNA。。。常用思绪包括特征显色、核酸酶处置惩罚、碱水解和电泳比照。。。单看紫外吸收值或电泳条带形态，，通常只能说明保存核酸，，不可自力证实它是DNA照旧RNA。。。
先看DNA与RNA能被区分的实验依据
DNA和RNA都由核苷酸组成，，但糖基结构差别：DNA含有脱氧核糖，，RNA含有核糖，，RNA比DNA多一个2'-羟基。。。这个差别带来三类可使用的效果：
- 化学反应差别：脱氧核糖可加入二苯胺反应，，核糖可到园地衣酚（orcinol）反应。。。
- 酶切敏感性差别：DNase主要降解DNA，，RNase主要降解RNA。。。
- 稳固性差别：RNA在碱性条件下更容易爆发水解，，DNA在相同的短时条件下相对稳固。。。
因此，，可靠判断通常不是只做一个反应，，而是设置空缺、已知DNA比照和已知RNA比照，，再把未知样品的转变与比照较量。。。若样品可能是混淆物，，还要把样品分成多个平行管，，划分举行处置惩罚。。。
只需要快速定性时：用平行显色反应起源判断
若是实验目的只是区分一份教学样品或提取液的大致类型，，可以选择二苯胺反应和地衣酚反应。。。操作时先将未知样品等量分装，，同时准备空缺管、已知DNA阳性比照和已知RNA阳性比照。。。所有试管使用相同体积、相同反应时间和相同温度，，阻止把操作差别误以为样品差别。。。
二苯胺反应：视察DNA倾向的蓝色转变
在经典酸性条件下，，DNA中的脱氧核糖经处置惩罚后可使二苯胺系统泛起蓝色或蓝绿色。。。若未知样品的颜色强度和已知DNA比照靠近，，而空缺管基本稳固，，可判断样品含有DNA的可能性较高。。。
需要注重，，颜色深浅不但由DNA决议，，还会受到样品浓度、加热时间、酸度和杂质影响。。。颜色很浅不可直接等同于“没有DNA”，，尤其是样品量较少或核酸已经部分降解时，，应连系核酸酶处置惩罚或电泳再次确认。。。
地衣酚反应：视察RNA倾向的绿色转变
地衣酚反应使用核糖在特定条件下形成反应产品，，RNA通常泛起绿色、蓝绿色或相近色调。。。若未知样品与已知RNA比照泛起相似的颜色，，罢了知DNA比照反应显着较弱，，说明样品中保存RNA的可能性较高。。。
该要领并非对RNA绝对专一，，其他含戊糖的物质、缓冲液因素和样品杂质都可能造成配景颜色。。。因此，，地衣酚阳性只能作为“RNA倾向”的证据，，最好与RNase处置惩罚后的条带转变或碱水解效果配合使用。。。
两种显色效果应怎样合并判断
| 二苯胺反应 | 地衣酚反应 | 起源判断 |
|---|---|---|
| 显着阳性 | 较弱或阴性 | 更切合DNA样品特征 |
| 较弱或阴性 | 显着阳性 | 更切合RNA样品特征 |
| 均有显着反应 | 均有显着反应 | 可能含DNA和RNA，，也可能保存显色滋扰 |
| 均不显着 | 均不显着 | 浓度过低、反应失效或样品并非可检测核酸 |
样品可能混适时：用DNase和RNase分组处置惩罚
当提取物来自细胞、组织或微生物，，往往不可预先假定其中只有一种核酸。。。这时，，分组酶切比纯粹显色更有诠释力。。。建议至少设置四组：未经处置惩罚的样品、加入DNase的样品、加入RNase的样品，，以及加入与酶液条件相同但不含酶的比照组。。。
- 将统一份样品等量分装，，只管使各管初始浓度一致。。。
- 凭证所用DNase或RNase产品说明书加入反应系统，，坚持推荐的缓冲液、温度和时间。。。
- 反应竣事后，，对各组举行琼脂糖凝胶电泳，，或检测处置惩罚前后的核酸信号转变。。。
- 将酶处置惩罚组与未处置惩罚组、无酶比照组较量，，而不是只视察某一条泳道。。。
若是DNase处置惩罚后主要条带显着削弱或消逝，，而RNase处置惩罚影响较小，，样品以DNA为主。。。相反，，若是RNase处置惩罚造成主要信号下降，，说明样品以RNA为主。。。若两种处置惩罚都只能消除一部分条带，，通常提醒样品中同时含有DNA和RNA，，或者保存酶切不完全、酶失活、盐离子不对适等实验因素。。。
关于含RNA的样品，，电泳时要特殊关注降解问题。。。RNA容易在操作历程中被核糖核酸酶破损，，可能体现为拖尾或弥散配景。。。此时不可简朴把“条带不清晰”诠释为没有RNA，，应先检查样品生涯、用具处置惩罚和电泳系统是否适合RNA。。。
需要使用稳固性差别时：做碱处置惩罚比照
RNA的2'-羟基使其在碱性条件下更容易爆发分子内水解，，而DNA缺少这一结构，，在相同的短时处置惩罚条件下通常更稳固。。？？？ ？梢越粗贩治创χ贸头Ｗ楹图畲χ贸头Ｗ，，反应后用电泳或其他核酸检测方法较量完整性。。。
若处置惩罚后原本的核酸信号显着断裂、削弱或转变为低分子片断，，而比照组转变较小，，效果更支持RNA保存。。。若主要高分子条带仍能坚持，，则更切合DNA特征。。。不过，，碱浓度、温度和时间必需由实验计划统一划定；；处置惩罚过强会造成非目的转变，，处置惩罚过弱则可能看不出差别。。。
只有电泳或分光光度计时，，应该怎样判断
电泳可以提供有价值的线索，，但不可仅凭条带位置完成DNA与RNA判别。。。DNA常体现为较大的高分子条带或靠近加样孔的信号；；真核细胞总RNA可能泛起较有纪律的核糖体RNA条带。。？？？ ？墒，，样品是否降解、分子巨细、变性条件和凝胶系统都会改变外观，，纯化RNA也纷歧定泛起典范条带。。。
A260可用于估算核酸浓度，，A260/A280可辅助判断卵白质污染，，但DNA和RNA在紫外区的吸收都很相近。。。因此，，分光效果适合回覆“核酸约莫有几多”和“纯度是否合适”，，不适合单独回覆“这是DNA照旧RNA”。。。
若是需要检测特定序列，，可将样品分成两条蹊径：DNA直接举行PCR，，RNA先逆转录天生cDNA，，再举行RT-PCR。。。同时设置无逆转录比照，，用于判断扩增信号是否来自残留DNA。。。这个要领既能判断模板类型，，也能回覆样品中是否含有目的序列，，但它依赖特异性引物，，不可替换对未知核酸的通用判别。。。
按实验目的选择最合适的组合
- 课堂演示或少量样品：选择二苯胺反应、地衣酚反应，，并配合已知DNA和RNA比照。。。
- 未知提取物或嫌疑混淆样品：优先接纳DNase、RNase平行处置惩罚，，再用电泳较量信号转变。。。
- 想使用结构稳固性差别：增添碱处置惩罚组，，但必需坚持处置惩罚条件可比。。。
- 需要确认特定基因或序列：接纳PCR与RT-PCR，，并设置无逆转录比照。。。
涉及强酸、加热或有机显色试剂时，，应凭证实验室标准操作规程举行，，使用合适的防护和透风条件。。。最终报告建议同时写明样品处置惩罚方法、比照设置、视察到的颜色或条带转变，，以及可能影响效果的因素。。。这样获得的结论应表述为“支持DNA为主”“支持RNA为主”或“提醒两者并存”，，比仅凭一次显色直接下绝对结论更可靠。。。
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